Sur la base de la littérature et d'un aperçu des collections de spécimens disponibles dans divers musées d'histoire naturelle, une liste des poissons fluviaux du Burundi a été compilée. Au total, 15 familles de poissons fluviaux contenant 42 genres et un total de 90 espèces indigènes décrites sont signalées pour le pays. Avec 35 espèces, la famille des Cyprinidae est de loin la plus importante, suivie par les familles Cichlidae (14), Clariidae (8), Mormyridae et Mochokidae (7). Les autres familles ne sont représentées que par cinq espèces ou moins. Dix espèces ont été introduites dans le système du Nil burundais et trois dans le système du fleuve Rusizi. Cinq d'entre eux n'ont aucune occurrence indigène connue au Burundi. Certains taxons tels que le petit 'Barbus' (Cyprinidae), le poisson-chat du genre Synodontis (Mochokidae) et les cichlidés haplochromes nécessitent une attention taxonomique accrue ; le nombre réel de leurs espèces est certainement sous-estimé