L’herbarium de l’OBPE est logé au sein du bureau à Jabe. Il conserve des espèces venues de plusieurs écosystèmes du Burundi surtout les aires protégées. Cependant, dans le cadre du Centre d’Echange d’Information en matière de la Diversité Biologique, l’OBPE à travers le Programme de recherche, échange d’information, sensibilisation et conservation de la biodiversité au Burundi, sous le financement de l’IRSNB a la mission de renforcer l’Herbarium suivant les normes Internationales. Pendant le mois d’Avril les activités comme l’étiquetage des herbiers de l’Herbarium, la vérification sur les écritures des espèces des plantes et l’enregistrement des échantillons conservées dans l’OBPE ont été effectuées.