Depuis plus d'une année, le Parc National de la Rusizi a subi des inondations sans précédent dues a la montée des eaux du lac Tanganyika. Ces inondations ont donc affecte la biodiversité dans deux sens: une dégradation de certaines espèces telle les arbustes (Acacia polyacantha) et une réapparition de certains autres (Cyperus latifolius).