C'est par le développement et la santé du biofilm que l'efficacité de purification est plus ou moins élevée. Lorsque les Cryptosporidium sont soumis à un stress fréquent, elles se regroupent et forment ce que l'on appelle un biofilm. Les biofilms naturels présentent un réseau très compliqué. Les biofilms de Cryptosporidium sont responsables de plusieurs maladies chroniques. La recherche porte sur les détails de la distribution, de la morphologie et de la composition des biofilms, dans les systèmes d'épuration des eaux usées. C’est dans cette optique que le présent travail vise à la quantification des biofilms en relation avec les variables physico-chimiques. Le biofilm étant défini comme une communauté de microorganismes irréversiblement associée à une surface et enfermée dans une matrice de substance polymère extracellulaire. Pour cette étude les échantillons ont été prélevés dans la station d’épuration des eaux usées de la Cité verte grâce à des techniques appropriées. Pendant l’étude les MES et la couleur ont pratiquement eu le même profil de variation. Les valeurs ont graduellement diminué au fur et à mesure que l’épuration suit son cour. Les occurrences des biofilms sont significativement et positivement corrélées aux MES et à la couleur car nous avons constaté que les occurrences des biofilms de Cryptosporidium spp. ont été plus élevées en début de l’épuration dans les premiers bassins. Les organismes parasites sont généralement liés aux matières organiques en suspension dans l’eau. Cette liaison occasionnée par des interactions électrostatiques, celles de Lifshitz-Van der Waals et acides-bases de Lewis. En conclusion, cette étude montre que les biofilms servent non seulement de réservoir environnemental pour les oocystes, mais sont également capables de favoriser la multiplication de Cryptosporidium en milieu aquatique. La présence des biofilms dans les stations d’épuration des eaux usées c’est plutôt un avantage car ils renferment une multitude de la biomasse épuratrice utile à l’épuration de l’eau. Le modèle représente la bio croissance en la présence de nutriments, son effet sur le transfert de masse et son interaction avec l'hydrodynamique dans les stations d’épuration des eaux usées. Il fournit également un outil pour l'évaluation des conditions menant à une résistance accrue à la perméabilité par rapport à l'engorgement des canaux.
