Deux espèces de taro sont cultivées au Burundi: Colocasia esculenta et Xanthosoma sagittifolium. Ces espèces sont devenues populaires et contribuent à l'alimentation en tant que source principale d’énergie. Mais, depuis ces 20 dernières années, une très forte tendance à la baisse de la production sur les deux espèces due à des contraintes biotiques a été observée. Des observations préliminaires sur terrain ainsi que des tests de laboratoire ont montré la prévalence d’infections virales et de champignons. Une recherche menée en 2013 au BecAILRI Hub a permis d’identifier le Dasheen Mosaic Virus (DsMV) sur des échantillons collectés au Burundi ainsi qu’un badnavirus non caractérisé à cette époque. Etant donné que la lutte contre les virus est de nature préventive, il est nécessaire d'obtenir une méthode de détection fiable et relativement peu chère. Les outils de diagnostic qui ont été développées pour les virus comprennent les tests ELISA et les tests PCR. Les tests PCR sont fiables, mais nécessitent des équipements coûteux ainsi qu’un personnel qualifié, qui ne sont pas toujours disponibles dans la plupart des stations de recherche. Le test LAMP a été identifié comme une méthode de laboratoire fiable et simple pour la détection des virus et autres agents pathogènes. Ce test fonctionne dans des conditions isothermes avec une efficacité comparable et même plus spécifique que la PCR. Les objectifs de cette recherche étaient les suivants: - identifier et valider la prévalence et la distribution des virus infectant les colocases au Burundi; - développer des tests de diagnostic sensibles et à coûts faibles pour les virus des colocases; - acquérir une expérience pratique sur l’analyse génomique et les techniques utilisées dans le développement de tests de diagnostic moléculaire.
