Le programme et outils de suivi de la biodiversité dans les parcs nationaux de la Kibira et Ruvubu ont été élaborés dans le cadre de la mise en oeuvre du projet "amélioration de l'efficacité du système de gestion des aires protégées pour la conservation de la biodiversité au Burundi". Ils ressortent d'un condensé de plusieurs éléments, outils et guides pour collecter et gérer les données, comparer les situations et interpréter la situation de la biodiversité à une époque donnée. Ils sont axés sur des points importants suivants :
a) Identification des espèces et des menaces phares pour le suivi de l’évolution de la biodiversité;
b) Définition des indicateurs et confection des fiches de suivi de l’évolution de la biodiversité;
c) Système d’enregistrement des données avec des fichiers en Excel;
d) Programme de suivi et enfin;
e) Conclusion.